Farmasötik Toksikoloji Anabilim Dalı; zehirlerin orijinleri, toksik maddelerin fiziksel, kimyasal ve biyolojik özellikleri, metabolizmaları ve etki mekanizmaları, toksik dozlar, zehirlenme tedavisi, zehirlerin ayrıştırılması, kalitatif ve kantitatif analizleri, güvenlik ve standardizayon bakımından toksik madde kullanımının risk analizi gibi konularda bilgi sağlamakla sorumludur. Ayrıca toksikoloji; ilaçların ters ve yan etkileri, toksik-ilaç etkileşimleri, ilaç aşırı dozajı ve suistimalinin sonuçları, çevresel ve endüstriyel kirlenme, meslek sağlığı konularıyla da ilgilenmektedir. Sağlık Bilimleri Enstitüsünün eğitsel amaçları doğrultusunda Farmasötik Toksikoloji Anabilim Dalı öğrencilere minimum 2 yıllık bir eğitim döneminden sonra Yüksek Lisans (M.Sc.) derecesine erişmeye olanak tanımaktadır. Eğitimleri sırasında öğrenciler, bilimsel ilkeler çerçevesinde kuramsal ve deneysel çalışmalar yapmak zorundadır.