Uluslararası İlişkiler Yüksek Lisans Programının temel amacı; öğrencilerin uluslararası ilişkiler ve bağlantılı bilim alanlarında; bilimsel araştırma yaparak bilgilere erişme, bilgiyi değerlendirme, kullanma ve yorumlama yeteneği kazanmasını sağlamaktır. Bu amaç doğrultusunda, öğrencilere ilgi alanlarına göre kendilerini geliştirebilecekleri geniş bir müfredat sunulmaktadır. Bu nedenle, uluslararası ilişkiler disiplininde mevcut bilgileri kazanmalarına dönük olarak ilk yarıyılda zorunlu olarak “ULİ 501 Uluslararası İlişkiler Teorileri”, “ULİ 503 Uluslararası Örgütlenme ve Örgütler”; ikinci yarıyılda ise “ULİ 502 Küresel Politikada Türkiye”, “ULİ 504 Uluslararası Hukuk ve Politika Dersleri” verilmektedir. Ayrıca, bilimsel araştırma yapmak için gerekli olan becerileri kazanmaları amacıyla öğrencilerin “SOB 501 Sosyal Bilimlerde Araştırma Yöntemleri Semineri” ve “ETK 503 Bilim Etiği” derslerini almaları zorunludur. Bu derslerin yanı sıra öğrencilerin uzmanlaşmak istedikleri alan ve bölgeleri içeren geniş bir ders havuzundan seçmeli dersleri tercih etmeleri sağlanmaktadır. Derslerini başarı ile tamamlayan öğrencilerin uzmanlık alanlarına göre program öğretim üyelerinin danışmanlığında tez yazım süreçleri yönetilmektedir. Böylece öğrencilerin temel kavram ve yöntemlerin yanı sıra kendi ilgi alanları uyarınca uzmanlaşmaları amaçlanmaktadır.
Son olarak, Uluslararası İlişkiler Yüksek Lisans programında eğitimlerini sürdüren öğrencilerden ilgi ve yetenekleri doğrultusunda doktora eğitimine yönlendirilmeleri hedeflenmiştir. Programda öğrenimlerine devam eden başarılı öğrenciler bu yönde istek ve taleplerini sıklıkla dile getirmektedir. Siyaset Bilimi ve Uluslararası İlişkiler Doktora Programının açılması ile öğrencilerin bu amaçlarının gerçekleşmesi mümkün kılınacaktır.