Akademik Dersler - Tanıtım

Ders Adı	Ders Kodu	Zorunlu/Seçmeli	Teori + Uygulama	AKTS
Medisinal Kimyada Moleküler Docking ve Dinamik Simülasyonu	FKM534	II.YARIYIL	3+0	6.0

Ders Dili	Türkçe
Ders Türü	Seçmeli Dersler
Öğretim Elemanları	DOÇ. DR. BEGÜM NURPELİN SAĞLIK ÖZKAN
Dersin Veriliş Biçimi	Bu ders sadece yüz yüze eğitim şeklinde yürütülmektedir.
Dersin Önkoşulları	Bu dersin ön koşulu ya da eş koşulu bulunmamaktadır.
Önerilen Dersler	Bu dersle ilişkili önerilen başka dersler bulunmamaktadır.
Okuma Listesi	1. Hinchliffe, A., "Molecular Modeling for Beginners", Wiley, Manchester, UK, 2008.2. Ramachandran, K.I., et al, "Computational Chemistry and Molecular Modeling", Springer, 2008.3. Muchmore, S.W., et al, "Chemoinformatics Tools for Medicinal Chemists", J. Med. Chem. (2010) 53, 4830-4841.4. Schlick, T., "Molecular Modeling and Simulation: An Interdisciplinary Guide" Springer, 2010.5. Redhu, S., Jindal, A.," Molecular Modeling: A New Scaffold for Drug Design, Int J Pharm Pharm Sci (2013) 5, 5-8.6. Scoichet, B.K., et al, "Lead Discovery Using Molecular Docking", Current Opin Chem Biol (2002) 6,439-446.
Değerlendirme	1 Ara sınav, 1 ödev, 1 dönem sonu sınavı
Staj & Uygulama	Staj yoktur.
Katalog İçeriği	Moleküler Modelleme: Moleküler modelleme yaklaşımları, İlaç tasarımında örnekler, Moleküler modelleme programları, Etkileşim analizi, İki boyutlu gösterim, Üç boyutlu gösterim; Protein Veri Bankası; Moleküler Docking: Ligand hazırlama, İlgili kristal seçimi, Protein hazırlama, Aktif yöre seçimi, İstatiksel analiz, Skorlama, Moleküler docking uygulamaları; Moleküler Dinamik Simülasyonu: Çıktıların analizi, Video analizi, Moleküler dinamik uygulamaları.